Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf3Q60803 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms