Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasa3Q60790 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasa3Q60790 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms