Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CttnQ60598 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CttnQ60598 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CttnQ60598 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CttnQ60598 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CttnQ60598 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CttnQ60598 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CttnQ60598 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CttnQ60598 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CttnQ60598 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms