Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trim38Q5SZ99 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trim38Q5SZ99 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Trim38Q5SZ99 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim38Q5SZ99 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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