Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sun3Q5SS91 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms