Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Trappc1Q5NCF2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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