Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim41Q5NCC3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim41Q5NCC3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms