Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Khdc1cQ4KL78 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms