Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Usp48Q3V0C5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Usp48Q3V0C5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Usp48Q3V0C5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Usp48Q3V0C5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Usp48Q3V0C5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Usp48Q3V0C5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Usp48Q3V0C5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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