Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc9Q3V038 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ttc9Q3V038 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ttc9Q3V038 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ttc9Q3V038 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc9Q3V038 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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