Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc27Q3V036 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms