Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn13Q3UW68 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms