Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28047Q3US59 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms