Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cracr2aQ3UP38 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms