Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tmem253Q3UNB8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tmem253Q3UNB8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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