Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc33Q3ULW6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms