Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms