Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms