Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gtpbp6Q3U6U5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms