Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U6N9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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