Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Q3U595 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q3U595 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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