Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ulk3Q3U3Q1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms