Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf149Q3U2C5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms