Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Palb2Q3U0P1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms