Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ankrd33bQ3U0L2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms