Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnnm2Q3TWN3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms