Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms