Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca4Q3TKT4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms