Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms