Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp39Q3TIX9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp39Q3TIX9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp39Q3TIX9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Usp39Q3TIX9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Usp39Q3TIX9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp39Q3TIX9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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