Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem248Q3TBN1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmem248Q3TBN1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms