Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms