Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlrp1aQ2LKU9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp1aQ2LKU9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms