Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim71Q1PSW8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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