Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptcd3Q14C51 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptcd3Q14C51 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms