Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
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ptchd1Q14B62 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ptchd1Q14B62 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ptchd1Q14B62 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ptchd1Q14B62 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ptchd1Q14B62 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ptchd1Q14B62 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ptchd1Q14B62 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ptchd1Q14B62 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ptchd1Q14B62 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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