Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Rpusd3Q14AI6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpusd3Q14AI6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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