Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf3ip1Q149C2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Traf3ip1Q149C2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms