Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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VgfQ0VGU4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VgfQ0VGU4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms