Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc162pQ0VG85 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc162pQ0VG85 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms