Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cpne7Q0VE82 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cpne7Q0VE82 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cpne7Q0VE82 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cpne7Q0VE82 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cpne7Q0VE82 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cpne7Q0VE82 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cpne7Q0VE82 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cpne7Q0VE82 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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