Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Itgb8Q0VBD0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms