Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata18Q0P557 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spata18Q0P557 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms