Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Znf541Q0GGX2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms