Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pate4Q09098 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pate4Q09098 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms