Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pou6f1Q07916 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pou6f1Q07916 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou6f1Q07916 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms