Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.43
AmbpQ07456 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
AmbpQ07456 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms