Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah1bQ06985 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms