Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sh3bp2Q06649 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sh3bp2Q06649 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sh3bp2Q06649 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sh3bp2Q06649 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bp2Q06649 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sh3bp2Q06649 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sh3bp2Q06649 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sh3bp2Q06649 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sh3bp2Q06649 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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