Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Runx1Q03347 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms